Biologia molekularna i bioinformatyka

Biologia molekularna i bioinformatyka

  • Analiza i optymalizacja ekspresji genów
  • Kompleksowa analiza transkryptomu komórek oparta na mikromacierzach wysokiej gęstości wraz z bioinformatyczną analizą wyników
  • Analiza ekspresji wybranych genów, miRNA za pomocą qRT-PCR
  • Monitorowanie ekspresji genów w czasie rzeczywistym, RT-PCR
  • Izolacja DNA, RNA, miRNA i białek z różnego typu materiałów biologicznych
  • Analiza i modyfikacja DNA
  • Przeprowadzenie reakcji PCR wraz z projektowaniem starterów;
  • Ocena jakości DNA, RNA i białek na bioanalizatorze
  • Analiza metylacji DNA za pomocą analizy HRM
  • Identyfikacja mikrobiologiczna (metody tradycyjne i molekularne)
  • Klonowanie molekularne i konstrukcja bakteryjnych wektorów ekspresyjnych
  • Tworzenie i skrining bibliotek mutantów
  • W żelu agarozowym i poliakrylamidowym (rozdział białek i kwasów nukleinowych)
  • Dwukierunkowa (2-DE) białek
  • Chipowa (Rozdział białek i kwasów nukleinowych)
  • Różnicowa dwukierunkowa (2D DIGE)
  • SDS-PAGE
  • Wysokorozdzielcza elektroforeza DNA w zakresie 50 – 700 pz (rozdzielczość 1-4 nt)
  • Elektroforeza kapilarna
  • Ukierunkowana mutageneza białek
  • Pozażelowe frakcjonowanie białek i kwasów nukleinowych
  • Fluorymetryczna analiza ilościowa białek i kwasów nukleinowych
  • Ekspresja rekombinowanych białek i jej optymalizacja (RT-PCR, Western Blot)
  • Wykrywanie określonych białek metodami Western Blot, ELISA
  • Immunodetekcja/chemiluminescencja białek
  • Identyfikacja białek trawionych enzymem proteolitycznym (MALDI, MALDI+nanoHPLC)
  • Analiza lizatów białkowych (typu Shotgun Proteomics)
  • Pomiar masy białka, peptydu lub białka trawionego enzymatycznie (MALDI-TOF/TOF lub ESI‑MS/MS)
  • Małych genomów (bakterie, drożdże, plazmidy BAC)
  • Dużych genomów (ludzie, rośliny, zwierzęta)
  • Egzomu
  • Rejonów DNA związanych z czynnikami regulacji
  • Małych RNA
  • RNAseq (profile ekspresji genów i sekwencjonowanie całego transkryptomu)
  • Celowane sekwencjonowanie transkryptów
  • Resekwencjonowanie celowane
  • Metylacja DNA / sekwencjonowanie całego genomu po reakcji z wodorosiarczynem (WGBS)
  • Identyfikacja SNP i wariantów strukturalnych metodą NGS
  • Przez sekwencjonowanie (RAD-seq)
  • SNPs za pomocą spektrometrii masowej typu MALDI-TOF oraz real-time PCR
  • Optymalizacja struktury przestrzennej białek, lipidów i węglowodanów
  • Wpływ rozpuszczalnika, jonów, rodników i zewnętrznego pola elektromagnetycznego
    na kształt cząsteczek
  • Badanie energii oddziaływań cząsteczek, oraz dynamiki układów
  • Określenie wpływu grup funkcyjnych i ligandów na strukturę i właściwości cząsteczki
  • Badanie zmian konformacyjnych cząsteczek

Metagenomika i badanie mikrobiomu (analiza 16s/ITS lub WGS)

Kontakt

Agata Dominiak

500 032 642

Formularz kontaktowy